Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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NfiaQ02780 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms