Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Muc1Q02496 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms