Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai1Q02085 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms