Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Grin2bQ01097 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms