Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms