Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms