Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms