Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms