Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gbx1P82976 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gbx1P82976 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Gbx1P82976 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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