Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms