Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx3P81067 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx3P81067 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms