Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux2P70298 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms