Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab3cP62823 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab3cP62823 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms