Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms