Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms