Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CirbpP60824 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CirbpP60824 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CirbpP60824 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CirbpP60824 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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