Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps5P59438 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms