Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms