Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms