Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gsc2P56916 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gsc2P56916 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gsc2P56916 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gsc2P56916 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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