Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5bP56480 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms