Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp5P56399 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp5P56399 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp5P56399 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp5P56399 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp5P56399 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms