Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms