Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NcanP55066 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NcanP55066 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NcanP55066 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NcanP55066 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NcanP55066 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NcanP55066 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
NcanP55066 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
NcanP55066 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NcanP55066 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NcanP55066 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms