Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb4P54761 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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