Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnfP51944 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnfP51944 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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