Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfP51642 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfP51642 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms