Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx3P50481 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms