Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SftpbP50405 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SftpbP50405 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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