Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cav1P49817 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cav1P49817 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cav1P49817 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cav1P49817 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cav1P49817 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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