Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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VegfbP49766 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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VegfbP49766 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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VegfbP49766 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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VegfbP49766 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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VegfbP49766 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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VegfbP49766 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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VegfbP49766 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfbP49766 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms