Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbp3P49194 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms