Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf1P39428 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms