Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprkP35822 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprkP35822 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprkP35822 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms