Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms