Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms