Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp4P35123 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp4P35123 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp4P35123 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp4P35123 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp4P35123 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp4P35123 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp4P35123 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp4P35123 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp4P35123 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp4P35123 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp4P35123 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp4P35123 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp4P35123 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp4P35123 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp4P35123 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp4P35123 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp4P35123 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp4P35123 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp4P35123 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp4P35123 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp4P35123 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp4P35123 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp4P35123 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Usp4P35123 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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