Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms