Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cd28P31041 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms