Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnd3P30282 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms