Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DcnP28654 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DcnP28654 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DcnP28654 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DcnP28654 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DcnP28654 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DcnP28654 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DcnP28654 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DcnP28654 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DcnP28654 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DcnP28654 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DcnP28654 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DcnP28654 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DcnP28654 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DcnP28654 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DcnP28654 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DcnP28654 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DcnP28654 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DcnP28654 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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DcnP28654 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DcnP28654 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DcnP28654 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DcnP28654 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DcnP28654 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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DcnP28654 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DcnP28654 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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DcnP28654 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DcnP28654 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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DcnP28654 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DcnP28654 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DcnP28654 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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DcnP28654 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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DcnP28654 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DcnP28654 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DcnP28654 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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DcnP28654 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DcnP28654 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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DcnP28654 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DcnP28654 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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DcnP28654 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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DcnP28654 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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DcnP28654 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DcnP28654 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DcnP28654 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DcnP28654 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DcnP28654 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DcnP28654 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DcnP28654 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DcnP28654 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DcnP28654 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DcnP28654 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DcnP28654 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DcnP28654 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DcnP28654 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DcnP28654 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DcnP28654 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DcnP28654 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DcnP28654 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DcnP28654 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DcnP28654 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DcnP28654 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DcnP28654 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DcnP28654 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DcnP28654 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DcnP28654 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms