Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pde6aP27664 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pde6aP27664 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pde6aP27664 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pde6aP27664 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pde6aP27664 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Pde6aP27664 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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