Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb7P26011 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms