Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nfkb1P25799 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms