Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms