Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms