Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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