Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ms4a2P20490 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms