Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms