Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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